色谱柱筛板用甲醇超声清洗，拧紧色谱柱，用甲醇低流速冲洗（20倍柱体积），就可以清洗的很干净。

对于色谱柱塌陷部分，找一根废弃的C18柱在出口处拧开，将靠近筛板的填料挖去一部分，再取干净的填料。再将要填修复的色谱柱入口拧开，除去污染的填料，将干净的填料用适宜的工具小心填充到色谱柱头，最好突出一部分），将过滤后的甲醇用微量进样针将填料湿润