安全工程师在报税时，可以凭借中级注册安全工程师资格证书享受个人所得税专项附加扣除， 最高可退3600元。具体依据如下：

新修订的个税法：

在计算个税应纳税所得额时，除了5000元基本减除费用扣除和“三险一金”等专项扣除外，还可以享受子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金，以及赡养老人等专项附加扣除。中级注册安全工程师证书属于国家职业资格证书目录范畴内，取得该证书的人员可以在取得证书的年度，按照每年3600元定额扣除。

国家职业资格目录清单：

注册安全工程师属于专业技术人员职业资格，在个税专项扣除的继续教育里，可以按3600元/年（年度汇算清缴）进行申报扣税。

因此，安全工程师在报税时，凭借中级注册安全工程师资格证书，可以享受3600元的个人所得税专项附加扣除，从而在年度汇算清缴时退还相应金额。建议取得中级安全工程师资格证书的人员及时申报，以充分利用这一税收优惠政策。