监理工程师变更任职的办理流程如下：

提出申请

申请人可以是建设单位、建设单位代表或监理工程师本人。

建设单位或代表需要向监理机构提出书面申请，说明变更的原因、由谁来担任新的监理工程师以及对新监理工程师的评价等方面的内容。

同时需要提交监理工程师的资格证书和相关工作经验证明文件。

审查申请

监理机构需要对变更申请进行审查，包括新监理工程师的资格认证、从监理机构角度判断新监理工程师是否能够胜任工作以及审查变更申请中的其他相关材料。

签订合同与变更协议

如果变更申请被批准，建设单位需要与新监理工程师签订新的合同，并于签订合同时签署变更协议。

变更协议中需要包含变更日期、新监理工程师的名称、执业证书号码以及其他有关变更的具体内容。

交接与沟通

新任监理工程师需要对原先的施工过程进行全面的了解，并与所有的相关方面进行沟通和协调。

需要向原监理工程师获取相关的资料和信息，以免存在遗漏。

备案

建设单位需要将监理机构变更的决定书及变更协议的原件及复印件，报送相关主管部门和有关部门盖章备案，以免在后续的工程验收及结算过程中出现瑕疵和问题。

其他相关手续

在注册管理系统办理变更注册手续，需要提交的材料包括《中华人民共和国注册监理工程师变更注册申请表》、申请人身份证件复印件、《中华人民共和国监理工程师执业资格证书》或《中华人民共和国监理工程师证书》复印件等。

建议：

监理工程师在变更任职时，应确保所有手续和文件齐全、准确，以便顺利完成变更流程。

变更过程中应保持与原监理工程师的沟通，确保信息的顺利交接，避免影响工程进度和质量。