二级建造师资格证书的颁发机构如下：

资格证书：

由各省、自治区、直辖市的人力资源和社会保障部门颁发。

注册证书：

在取得资格证书后，通过注册登记，由各省、自治区、直辖市的住房和城乡建设部门颁发。

需要注意的是，二级建造师执业资格证书在全国范围内有效，而注册证书通常在本省或直辖市内通用。