在选择二级建造师的专业时，考生应考虑以下因素：

个人专业背景

如果考生有建筑工程相关专业背景，选择建筑工程专业可能更为合适。

对于机电工程、水利水电工程等专业，如果考生有相关经验，选择这些专业可能更有优势。

市场需求

根据市场数据，建筑工程专业需求量大，报考人数多，通过率相对较高。

市政公用工程、机电工程等专业也有较高的市场需求，但可能竞争更为激烈。

就业前景

市政工程专业通常被认为是含金量高、就业前景好的专业，尤其在城镇化快速发展时期。

机电工程专业的持证人员相对较少，证书含金量较高，就业前景广阔。

个人兴趣与职业规划

考生应根据自己的兴趣和职业规划来决定报考哪个专业。

如果考生希望在工程行业担任项目经理，建筑工程专业可能是一个较好的选择。

考试难度

从考试难度来看，建筑工程专业相对容易通过，但可能因竞争激烈而含金量相对较低。

市政工程专业考试难度较大，但被认为是高含金量专业。

挂证需求

如果考生主要是为了挂证，建筑工程专业可能更为受欢迎，因为该专业证书持有者较多，市场流通性好。

综上所述，考生应根据自己的实际情况、兴趣、市场需求以及职业规划来选择合适的专业。