1、主要课程不同

临床医学专业的主要课程有人体解剖学、生理学、病原生物与免疫学、生物化学、病理学、药理学、诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、预防医学等核心课程。

麻醉学专业主要课程有内科学、外科学、妇产科学、儿科学、麻醉生理学、麻醉药理学、麻醉设备学、临床麻醉学、疼痛诊疗学等，包括了基本的临床医学的课程，但是还包括麻醉方面的具体课程。

2、培养目标不同

临床医学专业培养的主要方向为培养具备基础医学、临床医学的基本理论和医疗预防的基本技能，能在医疗卫生单位、医学科研等部门从事医疗及预防、医学科研等方面工作的医学高级专门人才，主要培养方向是具有独立分析问题和解决问题能力的临床医师。

而麻醉学致力于培养具有扎实的临床医学知识和麻醉学知识及技能，并能熟练掌握麻醉操作技术，胜任麻醉学科各项工作的初级麻醉医师。可从事麻醉学科及临床医学其他学科，如内科、外科等工作。