黑客帝国是许多读者都欣赏过的科幻电影，因为奇特的构思和诸多细节也是让一些影迷细细研究起剧中“细思极恐”的科技元素，比如Zion与母体的独特关系！而笔者认为，《黑客帝国》中Zion是和母体同级别的存在，至少它不是母体的子系统。

首先，整个电影可以理解为机器和人一同进化的故事。Neo作为人进化到能改变母体设定，Smith作为程序进化到能侵入锡安和人类的程度。Zion 是现实与虚拟（或者叫硬件与软件）融合很深的世界，除了人是真的，其它东西甚至机器总枢纽机器城都难辨真实或虚拟。整个三部曲还可以理解为是一个关于权限的故事。人或机器的权限（思维高度或者心灵解放程度）不一样，所看到的一切都不一样了，包括“目的”、“意义”、“选择”甚至对整个“系统”的理解都完全不同。

其次，影片中男主Neo每一次的升级，都在原来的世界里看到了截然不同的东西。权限高一级的人，跟人比起来就是“神”，就是这样。有人说影片中电子章鱼越打越多？其实没有越打越多。电影里说了，机器世界根据Zion人类的数量派遣了同样数量的电子章鱼。如果Zion是虚拟的，电子章鱼作为这个世界的清理角色，应该如同智能人在母体世界里一样无所不能才对——不会被破坏，不会害怕什么电磁波，不会和人类飞船玩躲猫猫的游戏。很明显不是的，人类在Zion世界里，虽然实力很弱，但还是可以对抗小规模电子章鱼的。

在母体世界里，即使是墨菲斯也打不过一个普通的智能人。电影中Neo第一次杀死Smith就是向Smith进程发送了kill信号；再比如给系统里的人打电话就是给他们的线程发送终止信号然后他们就下线脱离了系统回到了现实，系统内任意一个进程都具备接受这些signal的接口，因为这样可以帮助系统和用户对计算机的每个进程进行执行流程上的控制而不至于让进程处于”无法管理“的状态。

尽管Zion 被剿灭了五次，但总会有人类幸存下来，构成了原始人类。作为电池的人类，在Matrix里觉醒而成功进入现实世界。黑客帝国的故事背景是第六代救世主出现，和前五代不同的是，这一代Matrix也产生了自我意识。就像人类当年创造了人工智能，Matrix里的系统也有反抗机械生命的意思。至于尼奥可以通过大脑毁灭机械生命，是人类大脑进化的结果，可以直接感觉到到能量的流动，从而对其进行操控。特别是眼睛瞎了以后，视觉的消失更加强化了大脑的这种能力。

另外，影片中乌贼贯穿尼奥身体，这个问题好解释，金色代码代表，Neo在现实世界通过无线方式接入母体以后，可以看到同样接入母体的物理的代码。（其实关于绿色代码和金色代码都是一种表现形式而已）那个乌贼真正机械部分并没有贯穿尼奥身体。应当是撞在飞船前掉下去了，而他的金色代码在母体中是撞击了Neo的。所以用了这样的表现手法。

还有Neo口中放光是因为开始杀毒了，一台电脑运行都要发热，更不要说一个人了。大量的能量聚到Neo身体中，所以Neo开始发光，发热，当然Neo最后死了。Neo和其它从母体中出生的人一样，身上有大量的机械，能够无限联网，能够接入电脑，都是正常的，当然也会过载暴炸。导演这里用了比较唯美的方式来表现，给男主角留了一个全尸。

最后，我觉得先知和建筑师都认为Zion 是真实世界，这个从他们最后的对话能体现出来，要是Zion 是虚拟世界，建筑师就不会说先知玩了一个危险的游戏，毕竟虚拟的Zion 出了再严重的问题只要删掉就好了。当然要说有一个权限更高的存在，他建造了Zion 和Matrix并存的这个虚拟世界，无论生活在Zion 的人还是Matrix的人都没有察觉到他的存在，即使Matrix的最高权限者也不知情，从这个逻辑上来说的话，是没有办法证否的。所以我的结论是，Zion是和母体同级别的存在，至少它不是母体的子系统，母体的最高权限持有者也不能简简单单的消灭他[派一堆章鱼去物理毁灭不算。